Sovelluksia ovat jokien hiekanpoisto, järvien ruoppaus ja satamarakentaminen. Amfibioruoppausaloilla on erityisen tärkeä rooli kaupunkien vesistöjen hoidossa; ne eivät ainoastaan poista lietettä, vaan myös keräävät kelluvia roskia, mikä auttaa pitämään veden puhtaana. Lisäksi nämä ruoppaajat ovat erinomaisia rannikon maanparannustöissä ja navigointiväylien kunnossapidossa.
Poikkeuksellisen mukautumiskykynsä ja tehokkuutensa ansiosta amfibioruoppaajia käytetään laajalti eri aloilla:
Joen hallinta: Lieteen puhdistaminen joenuomista parantamaan purjehduskelpoisuutta ja tulvien hallintaa.
Järven sateenpoisto: Pohjasedimenttien poistaminen veden laadun parantamiseksi ja ekologisen ympäristön suojelemiseksi.
Sataman kunnossapito: Säännöllinen ruoppaus satama-alueilla varmistaa alusten turvallinen tulo ja sieltä poistuminen.
Kosteikkojen ennallistaminen: Ekologisen ennallistamisen toteuttaminen kosteikkoympäristöissä kosteikkoalueiden luonnollisten toimintojen elvyttämiseksi.